Au numéro 20 de la rue Caisserie, se trouvait l’emplacement de la chapelle des Pénitents Bleus de Notre-Dame de la Pitié, œuvre fondée en 1506, installée en ce lieu, au début du xixe siècle, dans une partie des anciens locaux des Augustines. Cette chapelle, après avoir servi d’entrepôt devient, au début des années 1920, salle de cinéma Populaire-Cinéma puis Massilia. Détruite après la Libération, avec d’autres maisons, elle laisser sa place à l’immeuble contemporain portant les numéros 16 à 26 et incluant une des dernières stations service du centre-ville de Marseille.
La rue doit son nom aux caisseries qui s’y trouvaient sous l’Ancien Régime. Elle s’appelait auparavant « rue Bernard-de-Caille » puis « rue des Mariet » du nom de ses propriétaires successifs. C’est historiquement, avec la Grand-Rue, la voie la plus ancienne de Marseille. Jusqu’à l’attaque du côté impair de la voie par les troupes allemandes en février 1943 durant la rafle de Marseille et sa reconstruction, la voie était beaucoup plus étroite.
